אין שיטה מוכרת לסיווג פיגמנטים. הסיבה לכך היא שיש סוגים רבים של פיגמנטים, ההרכב הכימי שונה מאוד, והשימושים שונים. לכן, איזו שיטה אינה אידיאלית לסיווג.
שיטת הסיווג הנפוצה יותר היא לחלק את הפיגמנטים לפיגמנטים אנאורגניים ופיגמנטים אורגניים בהתאם להרכב הכימי שלהם. מבחינת ביצועים, פיגמנטים אנאורגניים יש קלות טובה, עמידות בחום, כוח הסתרה חזק, אבל הכרומטוגרמה אינה שלמה מאוד, כוח הצביעה נמוך, בהירות הצבעים ירודה, וכמה מלחי מתכת ותחמוצות רעילים יותר. לפיגמנטים אורגניים יש מבנים מגוונים, כרומטוגרמות שלמות, גוונים בהירים וטהורים וכוח צביעה חזק, אך יש להם עמידות ירודה לאור, עמידות בפני מזג אוויר ויציבות כימית, והם יקרים יותר.
פיגמנטים פלואורסצנטיים מחולקים לפיגמנטים פלואורסצנטיים אנאורגניים (כגון פיגמנטים פלואורסצנטיים המשמשים במנורות פלואורסצנטיות ודיו פלואורסצנטיים נגד זיופים) ופיגמנטים פלואורסצנטיים אורגניים (הידועים גם בשם פיגמנטים פלואורסצנטיים באור יום): רק חומרים עם מבנים כימיים ספציפיים יכולים להיות בעלי תכונות פלואורסצנטיות. עם זאת, אלה צבעים פלואורסצנטיים עצמם לעתים קרובות יש ליקויים אינהרנטיים עמידות אור עמידות ממס. אחת הדרכים להתגבר על ליקויים אלה אינהרנטית היא להתיך אותם לתוך המסגרת של חומרים פולימריים באמצעות שיטות כימיות או פיזיות, ולאחר מכן עוד לעבד אותם לתוך פיגמנטים. חומר הפולימר המשמש למטרה זו לא רק פועל כממס עבור צבע פלואורסצנטי, אלא גם מספק הגנה עבור צבע פלואורסצנטי, ובכך נותן את צבע פלורסנט עמידות טובה יותר באור התנגדות ממס.
